Saturday, March 26, 2011

La hora de la Tierra


¿Ustedes creen que esto de verdad funciona?

Buscando más del asunto descubrí que es un movimiento contra el cambio climático que se le ocurrió a los de la WWF, la World Wildlife Fund (Fondo Mundial para la Naturaleza en español), esa del pandita. Inició en Australia, y ahora se pretende que sea de una cobertura más global. Llama la atención, y creo que se ve como una oportunidad de eventos públicos importantes.  
Pero uno no se puede dejar de preguntar de qué se trata y para qué es, o si sirve de algo. En la pagina del movimiento (al final del post) dice que La hora de la Tierra no solicita que se apagen las luces esenciales. También dice que no es una iniciativa que busque la reducción en el consumo de energía, dice que es "una acción simbólica para alentar a las personas, empresas y gobiernos de todo el mundo a tomar responsabilidades de su huella ecológica y participar en un diálogo y en el intercambio de recursos que ofrezca soluciones reales a los probelmas ambientales"... y dice también que simboliza un compromiso... mmmmmm........

Pues qué les diré yo. Creo que no es más que un evento de motivación, un intento por mostrar a las generaciones futuras que tratamos de hacer algo. 
Si ya se han firmado compromisos para la reducción de las emisiones y la protección al ambiente en cumbres improtantes de carácter mundial, y todavía hay países (así como el mio, cuya capital está incluida en el movimiento) que no se ponen de acuerdo para reformar las leyes para la venta y uso de energía. No creo que 60 minutos sin luz ahora hagan la diferencia.

No digo que no haya que hacer nada, al contrario, esto de la motivación es una cosa importante. Y creo que esa puede ser la única ganancia de esta inicitiva. Que hoy un niño muestre interés y en el futuro se convierta en un lider con consciencia ecológica. Si lo vemos así el panorama no es tan gris, y se justifica esto de querer convertir a La hora de la Tierra en un evento global. ¿Qué piensan?

Más información:
http://www.youtube.com/earthhour?feature=yoodle
http://www.earthhour.org/Homepage.aspx?intro=no

Friday, March 18, 2011

¡¡Bon voyage, bon vogaye!!

El retraso no quita el entusiasmo ni la intención.

Queremos felicitar a Melisa Hermosillo y a Nadia Arguijo. Las dos acaban de partir para representar a la Escuela, al lab y a su trabajo en diversos foros. Melissa Hermosillo presentó exitosamente su trabajo sobre humedales artificiales en la Cumbre Bi-nacional de Saneamiento Fronterizo y Calidad del Agua: Los retos de hoy, las opurtunidades del mañana, en San Antonio, Texas. Dicha cumbre se desarrolló estos días, entre el 16 y el 18 de marzo.


Por su parte, Nadia Arguijo hace unos dias partió al World Congress on Biotechnology en la ciudad de Hyderabad, India. En este evento ella presentará su trabajo "Performance of two methanogenic consortia immobilized on natural support in methane production during co-digestion process".


Desde luego, a las dos nuestros mejores deseos y felicitaciones por estos logros. ¡Éxito siempre! :D

Sunday, March 13, 2011

Hablando de proteínas... había una vez

Así es, había una vez una familia que vivía muy unida. La llamaban la familia proteína. Vivían adentro de un huevo, que estaba en una granja donde había muchas gallinas (obviamente), además de vacas, cerdos y otros animales. ¡Ah claro! Y también estaba el granjero. 

En esa familia, la familia proteína, había muchos hermanos. Había una muchacha muy bonita llamada Lisina, también estaban Glutamito y Aspartito. No eran, como pueden notar, una familia como quién dice normal. Aquí no había lo que normalmente se llaman padres, abuelos, tios… no.  Aquí a todos los miembros de la familia se les decía aminoácidos. Había muchos, algunos más fuertes que otros, pero todos eran muy unidos  siempre para formar a la famosísima familia proteína.


De todos los aminoácidos, Triptofanito era el líder. Y a diferencia de todos los demás era muy curioso. Había escuchado que fuera del huevo existían otros reinos. Y el que más le llamaba la atención era el reino del Cuerpo Humano, de donde el granjero era el rey. Después de hablar con toda la familia todos estuvieron de acuerdo en emprender el viaje al lejano reino del Cuerpo Humano. Y así, un buen día la casa se movió, el techo se abrió y todos se movieron… estaban entrando en una caverna… la boca del granjero. Triptofanito brincaba de alegría…

Tal vez no tiene mucho qué ver con la nota anterior, tal vez a estas alturas no debería andar recomendando esta clase de lecturas. Pero es un buen cuento de Julio Frenk, “Triptofanito”. El primero cuenta la historia de nuestro aminoácido amigo y como se va involucrando en el cuerpo del granjero, después siguen sus aventuras con la célula. ¿Lo han leído? ¿Qué les pareció? ¿Les interesa leerlo? ¿Alguien se apunta para el resumen y la traducción al inglés?
De ser así, pueden mandarme un mail. 
¡Muchos saludos y buen inicio de semana!

Thursday, March 10, 2011

Breaking the 'lock-and-key' model paradigma ?


After learn about the structure of the proteíns and enzimatic activity, I personally belive that EVERYTHING about the protein functions was related to the 3-D configuration, in fact, looking for information about the relation of enzyme stability ligated to the Ca++, I found this news:







Sunday, February 13, 2011

Biomimicry

Encontre una platica inspiradora, sobre disenios de arquitectura tomando como base a la naturaleza. Esa conferencia llevo a otra y a otra.
Termine asombrado, y con una excelente experiencia, verte tu crecimiento y luego ver como aun estan creciendo mas en otras partes del mundo. Esto agudiza tu sentido y te hace buscar mas opciones.
Nietzche una vez escribio sobre el conflicto entre la sabiduria y el conocimiento, y lleva a uno a la conclusion de que mientras el conocimiento es solo el almacenaje de datos y datos en tu cerebro o escritos, la sabiduria es la manipulacion de esos datos para hacer algo util o conveniente.
Estas platicas me recordaron esas palabras de Nietzche en cada diapositiva que cambiaban los expositores.
dejo los links para su regocijo



Saturday, February 12, 2011

¡Bienvenida!


En esta ocasión toca iniciar con el post de “bienvenida”.
En esta ocasión nuestro grupo recibe a Andrea Paola Arias Muñoz, estudiante de biología de la Universidad del Tolima, Colombia. Ella llega para incorporarse al grupo dentro de las actividades relacionadas a los proyectos de degradación anaerobia y estudio del comportamiento de los microorganismos involucrados. Esperamos que su estancia en nuestro país y en nuestro laboratorio sea de verdad muy provechosa.
¡Bienvenida Andrea!


Tuesday, February 1, 2011

¿Y el inicio?

Estudiando a fondo la estructura del ADN me puse a filosofar y como producto de las horas que llevo aquí estudiando me vino este pensamiento. En cuanto a genética, biología molecular y química todo parece perfección  cuando de ADN se esta hablando, el complejo desoxirribosa-fosfato-nucleótido queda como mandado a hacer con el -OH de la cadena naciente que lo espera acompañado de polimerasas y factores sigma sin el olvidar el as bajo la manga de las primasas (no se refiere a las hijazas del tillazo que regala nintendos en navidad) con su iniciador hecho de cadena sencilla pero de compleja y retorcida estructura que a veces parece de brazos abiertos y otras simplemente no se le haya ni pies ni cabeza.


Pues sí, todo esto parece fantasía. Es como si alguien me quisiera tomar el pelo y hasta me hiciera estudiar una MC para comprender algo que quizá inventó en un día  bien fumado (aunque los artículos digan lo contrario). A lo que mi post original iba es que sería excelente poder conocer el origen, el verdadero inicio, pues aunque Watson y Crick se mofaron de haber encontrado el secreto de la vida, yo me pongo amargado y un "poco" exigente y digo que aún no sabemos de donde salió el primer complejo desoxirribosa-fosfato-nucleótido que llevo a la necesidad de una ARN iniciador, que llevo a ... etc, etc.

Bueno pues, como quiera me sirvió para distraerme un poco de los que-haceres de la ciencia. 
Saludos a todos en Torreón!

Monday, January 31, 2011

Free genetic manipulation.

This is the summary of a summary.
Teachers in france have been offered the opportunity to teach their 16 year old students, how to genetically modify bacteria.
Agencies that advocate for strictier control of genitical engineering, such as CRIIGEN. They are concerned of modified E. coli cells, inserted with an ampicilin resistance plasmid, breaking out from the classroom to the environment.
But of course that those who manufacture E. coli manipulation kits, say that the practical is a useful tool for students and there is no risk in it. They sustain that the kit is equipped with sterilization procedures.
I support the opinion given by Valérie Sipahimalani, national secretary in charge of biology and geology for the National Union of Secondary Teachers. "Personally, I don't believe in teaching manipulation for manipulation's sake," she says. "More importantly, DNA takes a lot of time to explain — it is very complicated for secondary school-students to understand."

What do you think???

reference
http://www.nature.com/news/2011/110131/full/news.2011.61.html

Wednesday, January 19, 2011

Open access journals

This past few months have been harsh on studies.
Budgets for scolarships and study incentives are being decreased on some parts of the globe. (http://www.bbc.co.uk/podcasts/series/newspod#playepisode1)

In spite of oportunities becoming more scarce, there are still a few things we can benefit of...
Someone had mentioned this to me before, but because of my unaware nature i didn´t look into it, but i found a lot of open access journals on this page... http://www.doaj.org/
Lets take advantage of it while we can.

Wednesday, January 12, 2011

Machines are taking over!!

The tittle is a little exaggerated for what the post is about.
I read a paper published on 2009 so it's old, however i found it interesting.
Reflecting upon it, led me to the next train of thought:

We are aware that in our knowledge as humans, there are still great gaps, and we are yet to unravel nature's mysteries. The universe reminds us of our unmatured minds everytime it throws data that contradicts previous established dogmas, and we experience a paradigm shift or change.
Even so, in my opinion the paramount of science is far away but our knowledge is still advanced, sometimes i think it might be too advanced. The way of how biological systems are unable to cope with the changes provoked by our advances is an indicator of that.
Nonetheless we keep pressing forward. But in reality we must recognize our dependency on machines, since with these paper one can see that without computers our minds are not ready to process all the information we generate, however unlike our fellow machines we are able to interpret the processed data.
The paper compares protein families of different phylums that have their species completely sequenced. It then concludes something we all know but no one had processed and published, that protein families are greater as the number of genomes increase in a phylum.... seems logical huh?
But something really amazing when the group reprocessed all the data of the 4 different phylums was that they found an actin homologues in Haliangium ochraceum ¿?¿? (cri cri)
It is surprising because actin is a protein of the cytoskeletal of cells that is found in all eukaryotes and eukaryotes alone, while in the other two domains that cell shaping protein is substituted by MreB. MreB is considered distantly related to actins.

I won't spoil anymore...
Give laud to bioinformatics

References

Wu et al. 2009. A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea. Nature Letters, vol 462, 1056-1060.

Wikipedia